Con el propósito de recopilar, adaptar y montar un repertorio universal del periodo barroco, haciendo énfasis en el rescate y difusión de la música colonial latinoamericana y utilizando réplicas de instrumentos de la época, nace esta agrupación en 1999, por iniciativa de Luis Díaz Santana y Sonia Medrano Ruiz.
Después de un trabajo de acopio de material y años de estudio con especialistas, el grupo ha participado en importantes festivales del país, como el Tercer Festival Barroco de Morelia, Festival San Francisco en Tlaxcala, “Vive la Magia de la Cultura” en Guanajuato, en varias emisiones del “Festival del Desierto” y el Festival de Música Antigua y Barroca de San Luis Potosí.
En Querétaro, en el Festival de Música Antigua, organizado por la Escuela Nacional de Laudería y, en numerosas ocasiones, en el Festival Barroco de Guadalupe, Zacatecas.
La Capilla Barroca de Zacatecas se ha convertido en la principal promotora de obras del período barroco, por tal motivo representó a Zacatecas con el programa “Ópera en todos los Rincones del Centro Occidente” ofreciendo 21 funciones en ocho estados, siendo la primera ocasión, en el siglo XXI, en que la ópera recorrió de manera itinerante una región de México.